由于MySQL数据库的开源性，用户可以根据MySQL预定义的存储引擎接口编写自己的存储引擎。
一、常见存储引擎
1）InnoDB存储引擎
InnoDB存储引擎支持事务，其设计目标主要面向在线事务处理（OLTP）的应用。其特点是行锁设计、支持外键，并支持类似于Oracle的非锁定读，即默认读取操作不会产生锁。从MySQL数据库5.5.8版本开始，InnoDB存储引擎是默认的存储引擎。
InnoDB存储引擎将数据放在一个逻辑的表空间中，从MySQL4.1版本开始，它可以将每个InnoDB存储引擎的表单独放倒一个独立的ibd文件中。此外，InnoDB存储引擎支持使用裸设备（row disk）用来建立其表空间。
InnoDB通过使用多版本并发控制（MVCC）来获得高并发性，并且实现了SQL标准的4种隔离级别，默认为REPEATABLE级别。同时，使用一种被称为next-keylocking的策略来避免幻读（phantom）现象的产生。此外，InnoDB存储引擎还提供了插入缓冲（insert buffer）、二次写（double write）、自适应哈希索引（adaptive hash index）、预读（read ahead）等功能。
对于表中的数据，InnoDB存储引擎采用了聚集（clustered）的方式，每张表中的数据都是按主键顺序存放的。如果没有显示的定义主键，InnoDB存储引擎会为每一行生成一个6个字节的ROWID，并以此为主键。
2）MyISAM存储引擎
MyISAM存储引擎不支持事务、表锁设计，支持全文索引，主要面向一些联机分析处理（OLAP）数据库使用。此外，MyISAM存储引擎的另一个特点是它的缓冲池只缓存（cache）索引文件，而不缓冲数据文件，这和大多数的数据库都非常不同。
3）NDB存储引擎
NDB存储引擎是一个集群存储引擎，类似于Oracle的RAC集群，但不同的是Oracle RAC使用share everything架构，而NDB使用share nothing架构。
NDB的特点是数据全部放在内存中，因此主键查找（primary key lookups）的速度极快，并且通过添加NDB数据存储节点（Data Node）可以线性的提高数据库性能。
NDB存储引擎的连接操作（JOIN）是在MySQL数据库层完成的，而不是在存储引擎层，复杂连接操作造成的网络开销巨大，因此查询速度慢。
4）Memory存储引擎
Memory存储引擎（HEAP存储引擎）将表中的数据存放在内存中，如果数据库重启或崩溃，表中数据将全部丢失，它非常适合存储临时数据的临时表。Mymory存储引擎默认使用哈希索引，而不是B+树索引。
使用限制：Memory存储引擎只支持表锁，并发性能差，并且不支持文本（TEXT）和二进制大对象（BIOB）列类型，对于变长字段（varchar）是按照定长字段（char）存储的，会浪费内存。
5）Archive存储引擎
Archivie存储引擎只支持INSERT和SELECT操作，从MySQL5.1开始支持索引。Archive存储引擎使用zlib算法将数据行（row）进行压缩后存储，压缩比一般可达1：10。Archivie存储引擎非常适合存储归档数据，如日志信息。
6）Federated存储引擎
Federated存储疫情并不存放数据，它只是指向一台远程MySQL数据库服务器上的表，支持此MySQL数据库表，不支持异构数据库表。
7）Maria存储引擎
Maria存储引擎设计目标主要是为了取代原有的MyISAM存储引擎。
特点是：支持缓存数据和索引文件，应用了行锁设计，提供了多版本并发控制（MVCC）功能，支持事务和非事务安全的选项，以及更好的二进制大对象（BIOB）字符类型的处理性能。
二、存储引擎比较
下图取自MySQL官方手册。
